La citazione più remota dell’esistenza della Chiesa di San Sisinio risale al 1213, la Chiesa sottoforma di Cappella però, esiste già qualche anno prima, inserita nel vecchio castello che faceva parte del sistema di difesa dell’arco alpino. Questa imponente fortezza dominava dall’alto di Mendrisio. All'interno di quella che in origine era la Sala Parrocchiale, sono stati ricavati due spazi espositivi per i preziosi oggetti (suppellettili, reliquie, documenti, arredi) che i Priori della Torre si sono tramandati nei secoli.